《波斯王子2：武者之心》的故事緊接前作：由于王子釋放了神秘的時之沙，一個強大的時間怪獸Dahaka開始無情地追殺王子。Dahaka就像一個移動的黑洞一樣，不斷吞噬著一切東西，因此最好離它遠一點；王子認為他必須回到過去殺死時間女皇，阻止時之沙被制造出來。

　　王子將來到時間之島上一個荒廢的城堡中，在那里你會發現自己將在城堡中、神秘的山洞里、室外的花園中不斷戰斗，同時你也能在游戲中發現很多吸引人的設計風格。